RNA sekveneerimine

Kirjeldav

Näitaja kohta

RNA sekveneerimine on täppismeetod ribonukleiinhappe (RNA) nukleotiidide järjestuse kindlaksmääramiseks. Seda kasutatakse laialdaselt viiruste tuvastamiseks, pärilike haiguste diagnostikas, vähirakkude uuringutes ja geeniekspressiooni analüüsimiseks. Meetod võimaldab tuvastada isegi väikseimaid muutusi RNA sekveneerimises, mis võivad olla haiguste põhjuseks.

Mis on RNA sekveneerimine?

Funktsioon

RNA sekveneerimine võimaldab täpselt tuvastada RNA molekuli nukleotiidide järjestust.
Seda kasutatakse viiruste genotüüpide määramiseks (nt SARS-CoV-2, gripiviirus), et teha kindlaks nakkusallikas või ravimtundlikkus.
Meetod on oluline ka pärilike haiguste diagnoosimisel ja geeniekspressiooni mustrite analüüsimisel erinevates kudedes.

Meetodi olemus

RNA sekveneerimine põhineb proovist (nt veri, sülg, kude) eraldatud RNA analüüsimisel.
Kaasaegsed järgmise põlvkonna sekveneerimistehnoloogiad (NGS) võimaldavad kiireid ja väga täpseid tulemusi.
Erinevalt DNA sekveneerimisest on RNA sekveneerimine oluline aktiivselt toimuva geeniekspressiooni hindamiseks.

Protseduuri käik

Protseduur

Proovi võtmine: Sõltuvalt indikatsioonist võetakse prooviks veri, sülg, nina-nõosulme või kude.
RNA eraldamine: Proovist eraldatakse RNA spetsiaalsete kemikaalide ja tsentrifuugeerimise abil.
Pöördtranskriptsioon: RNA teisendatakens DNA-ks ensüümi (pöördtranskriptaasi) abil, kuna enamik sekveneerimistehnikaid analüüsib DNA-d.
Sekveneerimine: Saadud DNA sekveneeritakse, kasutades NGS-seadmeid, mis lõikavad DNA väikesteks tükkideks ja määravad nende järjestuse.
Andmete analüüs: Arvutiprogrammid võrdlevad saadud järjestust teadaolevate viiruste või geenide andmebaasidega.

Ettevalmistus

Enamasti ei ole vaja erilist ettevalmistust. Oluline on järgida arsti või labori juhiseid proovi andmise kohta.
Mõnedel juhtudel võib olla vaja mitte süüa või juua mõnda tundi enne vereproovi võtmist.

Positiivne RNA sekveneerimise tulemus

Mis see tähendab?

Positiivne tulemus viitab konkreetse RNA järjestuse olemasolule proovis. See ei ole automaatselt diagnoos, vaid andmed, mida arst koos muude sümptomite ja uuringutega hindab.

Levinumad põhjused positiivsele tulemusele

Viirusinfektsioon (nt gripp, COVID-19, hepatiit C) – tuvastatakse viiruse RNA.
Pärilikud haigused – tuvastatakse mutatsioonid spetsiifilistes geenides.
Vähk – RNA sekveneerimist kasutatakse kasvajarakkude spetsiifiliste mutatsioonide leidmiseks, et määrata sihtravimite sobivus.
Põletikulised protsessid – võib näidata teatud põletikuga seotud geenide kõrgendatud aktiivsust.

Indikatsioonid: millal tehakse uuring?

Peamised näidustused

Kahtlus viirusinfektsiooni kohta, eriti kui teised testid on ebaselged või on vaja tuvastada viiruse konkreetne tüvi (genotüüp).
Pärilike haiguste diagnostika perekonnas, kus on teada geneetiline eelsoodumus.
Vähidiagnoosil ja -ravil kasvaja spetsiifiliste mutatsioonide tuvastamiseks (sihtravimite valik).
Uute või haruldaste viiruste tuvastamine.
Teadusuuringud geeniekspressiooni, rakkude arengu või infektsioonimehhanismide uurimiseks.

Millised spetsialistid võivad uuringut tellida?

Infektsionist (infektsioonhaiguste eriarst)
Geneetik (geneetikauuringute spetsialist)
Onkoloog (vähiravime eriarst)
Laboriarst (kliinilise diagnostika spetsialist)

Seotud uuringud

Seotud haigused

Gripp 70% Askaridioos 70% Shigelloos 70% Kampülobakterioos 70% Jersinioos 70% Koolera 70% E. coli infektsioon 70% Clostridium difficile infektsioon 70% Malaaria (Paludism) 70% Tokspoplasmoos 70% Giardiaas (Giardia lamblia infektsioon) 70% Amoebiaas 70% Kriptosporidioos 70% Leishmanioos 70% Tripanosomiaas 70% Trihhomoonia 70% Enterobioos 70% Leptospiroos 70% Filarioos 70% Sporotrihhoos 70% Mukormükoos 70% Pneumocystise pneumoonia 70% Histoplasmoos 70% Kriptokokoos 70% Aspergilloos 70% Schistosomiaas 70% Anküloostoos (konksuhaigus) 70% Trihinelloos 70% Tokoskaroos 70% Ehinokokoos (Echinococcosis) 70% Teniaas (lintussiinfektsioon) 70% Vähikeseen (Trichuriasis) 70% Strongiloidoos 70% Rotihammust palavik 70% Sügel (Anthrax) 70% COVID-19 70% Varicella zosteri infektsioon 70% Anaplasmosis (Granülotsütootiline anaplasmosis) 70% Lyme'i haigus (Lyme'i borrelioos) 70% Mumps (Parotiit) 70% Leetrid (Rubeola) 70% Kuseinfektsioon 70% Tuulerõuged (Parotitis epidemica) 70% Herpes simplex viirusinfektsioon 70% Babesioos (Babesiosis) 70% Tsütomegaloviiruse infektsioon (CMV) 70% Nool 70% Rinoviirusinfektsioon 70% Adenoviirusinfektsioon (Adenoviirus) 70% Paragripi infektsioon (Paragripp) 70% RSV-infektsioon 70% Ehrlichioos 70% Marutaud 70% Tulareemia 70% Sepsis 70% Brucelloos 70% Listerioos 70% Legionelloos 70% Pneumokokiinfektsioon 70% Meningokokiinfektsioon 70% Septiline šokk 70% MRSA infektsioon 70% Difteria 70% Stafülokokkinfektsioon 70% Streptokokinfektsioon 70% erüsipelas 70% Skarlatiin 70% Botulism 70% Artroos 70% Dermatofütoos 70%

Otsi näitajat

Geenipaneeli sekveneerimine Mitokondriaalse genoomi sekveneerimine Sangeri sekveneerimine Terve genoomi sekveneerimine BRAF V600K mutatsiooni test CGG korduste uuring CYP19A1 geenitest CYP450 genotüüpimine EGFR ekson 20 uuring Egsoomide RNA Farmakogeneetiline põhjalik uuring Kardiovaskulaarse geneetika paneel Metabolismi geneetiline paneel Mitokondriaalse fissiooni uuring NTRK fuusioonid Nahamikrobiomi uuring Pikk mittekodeeriv RNA (lncRNA) uuring Päriliku kopsuvähi paneel Pärilikute haiguste uuring SEC23B geeni test