Mitokondriaalse genoomi sekveneerimine

Kirjeldav

Näitaja kohta

Mitokondriaalse genoomi sekveneerimine on geneetiline uuring, mis analüüsib mitokondriaalse DNA (mtDNA) täielikku järjestust. See meetod võimaldab tuvastada mutatsioone, mis võivad põhjustada mitokondriaalseid haigusi ja teisi pärilikke seisundeid. Uuring on eriti oluline neuraalsete, lihaste ja ainevahetushaiguste diagnostikas.

Funktsioon
  • Tuvastab mutatsioone mitokondriaalse DNA (mtDNA) järjestuses.
  • Analüüsib kõiki 37 mitokondriaalse genoomi geene, mis kodeerivad respiratoorse ahela valke.
  • Võimaldab diagnoosida pärilikke mitokondriaalseid haigusi.
Päritolu ja tähtsus
  • Mitokondriaalne DNA pärineb ainult emalt (maternaalne pärilus).
  • Mitokondrid on raku energiajaamad, seega mtDNA mutatsioonid mõjutavad energia tootmist.
  • Uuringu tulemused aitavad selgitada haiguse põhjusi ja anda perenõustamist.
Protseduur
  • Proovi võtmine: Tavaliselt veri (EDTA toru) või koeproov (näiteks lihas).
  • DNA eraldamine: Proovist eraldatakse mitokondriaalne DNA.
  • Sekveneerimine: Kasutatakse kõrgjõudlisi sekveneerimistehnoloogiaid (NGS) kogu genoomi analüüsiks.
  • Andmete analüüs: Saadud järjestust võrreldakse viitegenoomiga, et leida patogeensed mutatsioonid.
Ettevalmistus
  • Erilist ettevalmistust enamasti ei vaja.
  • Kui prooviks on veri, võib olla vaja paastuda (seda ütleb arst).
  • On oluline esitada täielik meditsiini- ja pereajalugu.
Positiivne tulemus (mutatsiooni tuvastamine)
  • Tuvastatud mutatsioon on seotud mitokondriaalse haigusega (nt MELAS, MERFF, Leigh'i sündroom).
  • Kinnitab kahtlustatud diagnoosi ja selgitab sümptomeid (näiteks lihasenõrkus, neuroloogilised häired).
  • Võimaldab hinnata riski teiste pereliikmete ja tulevaste põlvede jaoks (perenõustamine).
Negatiivne tulemus
  • Tavaline mtDNA järjestus – tuvastatud mutatsioone ei ole.
  • Haiguse põhjus võib olla mujal (nukleaarses DNA-s või muudes tegurites).
  • Võib olla vaja täiendavaid uuringuid.
Mittedetermineeriv tulemus
  • Leitakse ebakindel variatsioon (VUS – Variant of Uncertain Significance), mille tähendus pole teada.
  • Võib olla vaja pereliikmete testimist või täiendavaid uuringuid aja jooksul.
Kliinilised sümptomid
  • Neuroloogilised häired (atroofia, arengupuuetus, intellektipuue, migreen).
  • Lihasenõrkus, väsimus, füüsilise koormuse talumatus.
  • Mitme organisüsteemi kaasatus (nägemis- või kuulmispuue, südame-, maksa- või neeruhäired).
  • Metaboolsed häired (laktaatatsidoos, energiapuudulikkus).
Perelugu
  • Perekondades, kus on esinenud sarnaseid sümptomeid (eriti emaliinis).
  • Varajane suremus või rasked arenguhäired peres.
Spetsialistid, kes võivad uuringut tellida
  • Neuroloog
  • Geneetik
  • Laste- ja täiskasvanute neuroloog
  • Meditsiinilise geneetika spetsialist