Pikk mittekodeeriv RNA (lncRNA) uuring

Kirjeldav

Näitaja kohta

Pikk mittekodeeriv RNA (lncRNA) uuring on molekulaarbioloogiline analüüs, mis võimaldab tuvastada ja analüüsida pikki mittekodeerivaid RNA molekule rakus. Need RNA-d ei kodeeri valke, kuid mängivad olulist rolli geeni regulatsioonis, raku erinevuses ja haiguslike protsesside kujunemis. Uuring aitab mõista raku siseprotsesse ning võib olla kasulik mitmete krooniliste haiguste ja kasvajate diagnoosimisel ja uurimisel.

Mis on pikk mittekodeeriv RNA (lncRNA) uuring?

Funktsioon

lncRNA-d on RNA molekulid, mis on pikemad kui 200 nukleotiidi ja mis ei kodeeri valke.
Need osalevad geeni ekspressiooni reguleerimises epigenectilisel tasandil, mõjutades kromatiini struktuuri ja transkriptsiooni.
lncRNA-d on seotud raku arengu, diferentseerumise, immuunvastuse ja rakkude jagunemise protsessidega.

Uuringu olemus

Uuring hõlmab lncRNA-de väljaeraldamist ja sekveneerimist proovist (nt vere- või kudeproov).
Tulemused annavad teavet lncRNA-de ekspressiooni tasemete kohta, mida saab võrrelda normalse või patoloogilise seisundiga.
Meetodid: RT-qPCR, RNA-sekveneerimine (RNA-seq), mikrokiip-analüüs.

Uuringu protseduur

Protseduur

Proovi võtmine: Tavaliselt veri (vereplasma või seerum) või kudeproov (näiteks biopsia).
RNA ekstraheerimine: Proovist eraldatakse kogu RNA, sealhulgas lncRNA-d.
Puhastamine ja kontsentratsiooni mõõtmine: RNA kvaliteedi ja koguse hindamine.
Pöördtranskriptsioon: RNA pööratakcDNA-ks ensüümide abil.
Kvantitatiivne PCR (qPCR) või sekveneerimine: lncRNA spetsiifiliste geenide tuvastamine ja kvantifitseerimine.
Andmete analüüs: Saadud tulemuste võrdlemine kontrollgrupi või viitereaktiividega.

Ettevalmistus

Erilist ettevalmistust enamasti ei vaja, kuid võib olla vaja eelnevalt arstiga konsulteerida.
Proovi võtmise aeg ja patsiendi seisund võivad mõjutada lncRNA ekspressiooni, mistõttu on oluline järgida labori juhiseid.

lncRNA tõstunud ekspressiooni tulemuste tõlgendamine

Patoloogilised seisundid

Vähkkasvajad: Mitmed lncRNA-d on seotud kasvajate kasvu, metastaaside tekkega ja kemoresistentsusega (nt HOTAIR, MALAT1).
Kardiovaskulaarsed haigused: lncRNA-d võivad osaleda ateroskleroosi, südamepuudulikkuse ja hüpertensiooni patogeneesis.
Neuroloogilised häired: Alzheimeri tõbi, Parkinsoni tõbi, autoimmuunhaigused nagu multiple skleroos.
Krooniline põletik: lncRNA-d reguleerivad põletikuvastuseid ja võivad soodustada põletikuliste haiguste (nt reumatoidartriit) kujunemist.

Füsioloogilised tegurid

Vanus: lncRNA ekspressioon võib muutuda vananedes.
Rakkude diferentseerumine ja areng: lncRNA-d on aktiivsed embrüonaalses arengus ja tüvirakkude diferentseerumisel.

Indikatsioonid: millal lncRNA uuringut tehakse?

Meditsiinilised olukorrad

Vähkkasvajate diagnostika, prognoosi hindamine ja ravi kohandamine (Onkoloogia).
Põletikuliste ja autoimmuunhaiguste uuring (Reumatoloogia, Immunoloogia).
Südame-veresoonkonna haiguste riski hindamine ja patogeneesi uurimine (Kardioloogia).
Neuroloogiliste haiguste uurimine (Neuroloogia).
Geneetiliste ja metaboolsete häirete analüüs (Endokrinoloogia, Geneetika).

Spetsialistid