Digitaalne PCR (dPCR)

Kvalitatiivne

Näitaja kohta

Digitaalne PCR (dPCR) on täppismeetod DNA või RNA molekulide absoluutse koguse määramiseks. See on traditsioonilisest PCR-st täpsem, eriti väikese kogusega algnäidiste analüüsimisel ja mutatsioonide tuvastamisel.

Funktsioon
  • DNA või RNA sihtjärjestuste äärmiselt täpne detekteerimine ja kvantifitseerimine.
  • Kasutatakse haigusdiagnostikas, geneetilises testimises ja vähiuuringutes.
Põhimõte
  • Näidis jagatakse tuhandeteks mikrosegmentideks, millest igaühes toimub eraldi PCR reaktsioon.
  • Tulemuste põhjal loendatakse positiivsed (sihtjärjestus olemas) ja negatiivsed segmendid, mis võimaldab absoluutset kvantifitseerimist.
Protseduur
  • Näidise kogumine (nt veri, koeosake, sülg).
  • DNA või RNA eraldamine näidisest.
  • Eraldatud nukleiinhappe lahjendamine ja jaotamine mikrosegmentideks.
  • PCR amplifitseerimine iga mikrosegmendi kohta eraldi.
  • Fluorestsentssignaalide tuvastamine ja andmete analüüs positiivsete/negatiivsete reaktsioonide baasil.
  • Arvutused, et määrata sihtjärjestuse täpne kopiate arv algnäidises.
Ettevalmistus
  • Enamasti erilist ettevalmistust ei vaja, sõltub näidise tüübist.
  • Järgida arsti või labori juhiseid näidise andmise kohta.
Tähendus
  • Positiivne tulemus tähendab, et otsitav DNA või RNA järg (nt viiruse, mutatsiooni, bakteriaalne geen) on näidises tuvastatud.
  • Kvantitatiivne tulemus näitab selle järje kontsentratsiooni näidises.
Võimalikud põhjused
  • Aktiivne infektsioon (nt SARS-CoV-2, HIV, hepatiit).
  • Pärilik haigus või geneetiline muutuja kandlus.
  • Kasvaja või vähirakkude esinemine (tsirkuleeriv tumor-DNA).
  • Mikroobide (nt bakterite, seente) olemasolu.
Peamised rakendusalad
  • Virusinfektsioonide täpne diagnoos ja viiruse koormuse mõõtmine.
  • Vähi geneetiliste biomarkrite (nt mutatsioonid) tuvastamine ja jälgimine.
  • Pärilike haiguste (nt tsüstilise fibroosi, muskulüdüstroofia) diagnostika.
  • Mikrobioloogiline diagnostika, kui traditsioonilised meetodid ei piisa.
  • GMO-de või patogeensete organismide tuvastamine toidus ja keskkonnas.
Kes tellib või soovitab?
  • Infektoloog
  • Onkoloog
  • Geneetik
  • Mikrobioloog