Digitaalne PCR (dPCR)
Kvalitatiivne
Näitaja kohta
Digitaalne PCR (dPCR) on täppismeetod DNA või RNA molekulide absoluutse koguse määramiseks. See on traditsioonilisest PCR-st täpsem, eriti väikese kogusega algnäidiste analüüsimisel ja mutatsioonide tuvastamisel.
Funktsioon
- DNA või RNA sihtjärjestuste äärmiselt täpne detekteerimine ja kvantifitseerimine.
- Kasutatakse haigusdiagnostikas, geneetilises testimises ja vähiuuringutes.
Põhimõte
- Näidis jagatakse tuhandeteks mikrosegmentideks, millest igaühes toimub eraldi PCR reaktsioon.
- Tulemuste põhjal loendatakse positiivsed (sihtjärjestus olemas) ja negatiivsed segmendid, mis võimaldab absoluutset kvantifitseerimist.
Protseduur
- Näidise kogumine (nt veri, koeosake, sülg).
- DNA või RNA eraldamine näidisest.
- Eraldatud nukleiinhappe lahjendamine ja jaotamine mikrosegmentideks.
- PCR amplifitseerimine iga mikrosegmendi kohta eraldi.
- Fluorestsentssignaalide tuvastamine ja andmete analüüs positiivsete/negatiivsete reaktsioonide baasil.
- Arvutused, et määrata sihtjärjestuse täpne kopiate arv algnäidises.
Ettevalmistus
- Enamasti erilist ettevalmistust ei vaja, sõltub näidise tüübist.
- Järgida arsti või labori juhiseid näidise andmise kohta.
Tähendus
- Positiivne tulemus tähendab, et otsitav DNA või RNA järg (nt viiruse, mutatsiooni, bakteriaalne geen) on näidises tuvastatud.
- Kvantitatiivne tulemus näitab selle järje kontsentratsiooni näidises.
Võimalikud põhjused
- Aktiivne infektsioon (nt SARS-CoV-2, HIV, hepatiit).
- Pärilik haigus või geneetiline muutuja kandlus.
- Kasvaja või vähirakkude esinemine (tsirkuleeriv tumor-DNA).
- Mikroobide (nt bakterite, seente) olemasolu.
Peamised rakendusalad
- Virusinfektsioonide täpne diagnoos ja viiruse koormuse mõõtmine.
- Vähi geneetiliste biomarkrite (nt mutatsioonid) tuvastamine ja jälgimine.
- Pärilike haiguste (nt tsüstilise fibroosi, muskulüdüstroofia) diagnostika.
- Mikrobioloogiline diagnostika, kui traditsioonilised meetodid ei piisa.
- GMO-de või patogeensete organismide tuvastamine toidus ja keskkonnas.
Kes tellib või soovitab?
- Infektoloog
- Onkoloog
- Geneetik
- Mikrobioloog
Seotud uuringud
Otsi näitajat
Digitaalne dermatoskoopia
Digitaalne verelembe morfoloogia
digitaalne mammograafia
Minimaalse jääkhajuse PCR-test (MRD-PCR test)
11-dehidrotromboksaani B2
11-deoksükortisool
13q deletsiooni uuring
14-3-3 valk CSF-is
16-alfa-hüdroksüestron
17-alfa-hüdroksüprogesteroon
17-hüdroksüprogesteroon
1q amplifikatsiooni uuring
2-hüdroksüestrioon
2-metoksüestron
2-tunnine glükoositaluvuse test
216 toidu intolerantsuse uuring
24 tunni uriinikreatiinini tase
24-tunnine Holteri monitorimine
24-tunnine pH-meetria
24-tunnine uriinalbumiin