Mikromassiivide CGH (aCGH) uuring

Kirjeldav

Näitaja kohta

Mikromassiivide võrdleva genoomne hübridiseerimine (CGH või aCGH) on kromosoomide kõrge eraldusvõimega analüüsimeetod, mis tuvastab genoomis esinevaid DNA kopeeruste arvu muutusi (kopeeruste arvu variatsioone, CNV-d). See on oluline meetod eriti kaasasündinud arenguhäirete, vaimse alaarengu ja mitmete haiguste põhjuse selgitamisel. Uuring võimaldab tuvastada väikseid kromosoomide lisandusi või kadusid, mida tavalise kariotüpiseerimisega näha ei ole.

Mis on Mikromassiivide CGH (aCGH) uuring?

Funktsioon

DNA kopeeruste arvu muutuste (CNV-de) tuvastamine kogu genoomis.
Kromosoomide väikeste lisanduste (duplikatsioonide) või kadude (deletsioonide) tuvastamine, mida mikroskoobiga ei näe.
Kaasasündinud sündroomide, arenguhäirete või mitmete haiguste geneetilise põhjuse selgitamine.

Meetodi olemus

Patsiendi DNA võrreldakse tervet võrdlus-DNA-ga (nn referents-DNA-ga), mis on tavaliselt saadud tervetelt indiviididelt.
DNA proovid märgistatakse erinevate fluorofooridega ja hübritiseeritakse spetsiaalsele mikromassiivile, mis sisaldab tuhandeid kindlate genoomipiirkondade jaoks spetsiifilisi proobe.
Fluorestsentssignaalide suhe näitab, kas konkreetses piirkonnas on DNA kopeeruste arv normist erinev (rohkem või vähem).

Uuringu läbiviimine ja ettevalmistus

Protseduur

Uuringu jaoks vajatav DNA saadakse tavaliselt verest (leukotsüütidest), süljest või koeproovist (nt villientsüübi või amnionivedeliku rakud).
DNA ekstraheeritakse, puhastatakse ja amplifitseeritakse.
Patsiendi DNA ja referents-DNA märgistatakse erinevate värvainetega (nt punase ja rohelise fluorofooriga).
Mõlemad DNA-proovid segatakse ja hübritiseeritakse ühiselt mikromassiivile, mis sisaldab tuhandeid spetsiifilisi DNA sekventse.
Pärast hübritiseerimist pestakse massiiv ja skannitakse spetsiaalse skanneriga, et tuvastada iga punkti fluorofooride suhe.
Andmeid analüüsitakse spetsiaalse tarkvaraga, mis tuvastab kopeeruste arvu muutused.

Ettevalmistus

Erilist ettevalmistust enamasti ei vaja. Veriproovi võtmiseks ei ole vaja olla tühi kõht.
Oluline on arsti poolt antud selgitus uuringu eesmärgi ja tulemuste võimalike tagajärgede kohta (geneetiline nõustamine).

Positiivne (leideline) Mikromassiivide CGH (aCGH) tulemus

Mida see tähendab?

Positiivne tulemus tähendab, et genoomis on tuvastatud patsiendi DNA kopeeruste arvu muutus (CNV) võrreldes tervet võrdlus-DNAd.
See võib olla DNA lisaosa (duplikatsioon) või kadumine (deletsioon).

Võimalikud seletused ja tähendus

**Patogeensed muutused:** Muutus on haiguse põhjustaja. Sellised leidud seletavad patsiendi sümptomeid (nt arenguhäire, omapärane välimus, sündroom).
**Beniinsed variatsioonid (polümorfismid):** Muutus on tavaline variatsioon, mis esineb ka tervetel inimestel ja ei põhjusta haigust. Selle eristamine patogeensest muutusest on väga oluline.
**Ebaselge tähendusega muutused (VUS):** Pole veel teada, kas muutus on patogeenne või beniinne. Tulemust võidakse täiendavalt analüüsida pereliikmete uuringute või andmebaaside põhjal.

Järgmised sammud positiivse tulemuse korral

Tulemuste põhjalik arutelu geneetikuga (geneetiline järgimisnõustamine).
Võimalusel vanemate või teiste pereliikmete uuring, et selgitada muutuse päritolu (kas pärilik või uus).
Kliinilise tähenduse hindamine koos patsiendi sümptomite ja anamneesiga.
Vajadusel võib olla soovitatavad täiendavad uuringud või erialane ravi ning toetavad meetmed.

Indikatsioonid: millal soovitatakse Mikromassiivide CGH (aCGH) uuringut?

Peamised meditsiinilised põhjused

Kaasasündinud anomaaliad/väärarengud (nt südame-, aju-, luude arenguhäired).
Selgituseta vaimne alaareng või arenguhäire (nt hiline kõne- või motoorne areng).
Autismispektri häire või selle kahtlus.
Mittespetsiifiline fenotüüp, mis viitab geneetilisele sündroomile, kuid tavalise kariotüübi uuring on normaalne.
Korduvad spontaonsed abortid või viljatus (mõlemal partneril).
Onkoloogiliste haiguste korral (mõned tumorid), et tuvastada spetsiifilisi geneetilisi muutusi.

Millised spetsialistid võivad uuringut tellida?

**Geneetik** on selle uuringu peamine spetsialist ja nõustaja.
**Lastearst** või **lasteneurolog** laste arenguhäirete korral.
**Neurolog** või **psühhiaater** autismispektri häirete või mõne neuroloogilise sündroomi korral.
**Günekoloog** või **reproduktoloog** viljatuse või korduvate abortide põhjuste selgitamisel.
**Perearst** või **sisemeditsiiniarst**, kes viib patsiendi edasi geneetilisele konsultatsioonile.