Genoomi stabiilsuse uuring
Kirjeldav
Näitaja kohta
Genoomi stabiilsuse uuring (MSI-test) on molekulaarne geneetiline analüüs, millega hinnatakse kudede, eriti kasvajates, esinevaid mutatsiooniprotsesse. See aitab tuvastada haigusi, mis on seotud DNA parandusüsteemi vigadega, ning on oluline diagnoositool onkoloogiliste haiguste, nagu pakssoolevähk, korral.
Funktsioon
- Hindab DNA mikrosatelliidide (korduvate jadade) stabiilsust rakkudes.
- Tuvastab DNA parandusmehhanismide defekte, mis viivad mutatsioonide kogunemiseni.
- Võimaldab hinnata kasvaja geneetilist profil, mis võib mõjutada ravivalikuid.
Rakendus
- Kasutatakse peamiselt onkoloogias kasvajate subtiipide määramiseks.
- Oluline uuring Lynch'i sündroomi (päriliku mittepoliipoosse pakssoolevähi) diagnostikas.
- Tulemused võivad aidata ennustada immuunterapia vastumärkimust.
Protseduur
- Uuringuks võetakse biopsiaproov kasvajast (nt operatsiooni või biopsia ajal) ja võrdluseks tervetest kudedest (nt veri või sülg).
- Proovid töödeldakse laboris, kus eraldatakse DNA.
- DNA-st analüüsitakse spetsiifilisi mikrosatelliidimarkereid, võrreldes kasvaja ja normaalse koekoe tulemusi.
- Tulemused esitatakse kui stabiilne (MSS) või ebastabiilne (MSI-H või MSI-L).
Ettevalmistus
- Patsiendil pole vaja erilist ettevalmistust. Kui kasutatakse olemasolevat biopsiaproovi, piisab selle saamisest.
- Oluline on patsiendi arstlik anamnees, eriti perekonnalugu vähktõvest.
Peamised põhjused
- Lynch'i sündroom (HNPCC) – pärilik seisund, mis suurendab oluliselt eriti pakssoole- ja emakakaelavähi riski.
- Mittepärilikud pakssoolevähi vormid, kus on esinenud DNA parandusgeenide mutatsioonid.
- Mõned teised kasvajad, nagu mao-, seedekulgla- või nahavähk, võivad samuti näidata genoomilist ebastabiilsust.
Kliiniline tähtsus
- MSI-H kasvajad on sageli parema prognoosiga võrreldes MSI-negatiivsete kasvajatega samas staadiumis.
- Need kasvajad võivad olla tundlikumad teatud tüüpi kemoterapia ja eriti immuunterapia vastu.
- Positiivne tulemus võib viidata vajadusele perekonnasüstemaatilisele geneetilisele nõustamisele ja läbivaatustele.
Meditsiinilised olukorrad
- Varajase ea pakssoolevähk (alla 50 aasta vanused).
- Patsiendil, kellel on mitu sünkroonset või metakroonset vähktõve (eriti pakssool ja emakas).
- Perekondlik anamnees vähktõve kohta, mis viitab Lynch'i sündroomile.
- Ebatavalise histoloogiaga või spetsiifiliste tunnustega pakssoolekasvaja korral.
Spetsialistid, kes võivad uuringu tellida
- Onkoloog – vähktõve ravi kavandamisel ja prognoosi hindamisel.
- Gastroenteroloog või kolorektaalkirurg – pakssoolekasvaja diagnoosimisel.
- Kliiniline geneetik – pärilike sündroomide hindamisel.
- Patoloog – kasvaja histoloogilise iseloomustamise täiendamisel.
Seotud uuringud
Seotud haigused
Lynchi sündroom
85%
Familiarne adenomatoosne polüpoos (FAP)
80%
Peutz-Jeghersi sündroom
75%
Cowdeni sündroom
70%
Li-Fraumeni sündroom
65%
Päritud rinna- ja munasarjavähi sündroom (HBOC sündroom)
60%
Neurofibromatoos
55%
Von Hippel-Lindau sündroom
50%
MEN sündroomid
45%
Paksu soole vähk
40%
Mao vähk (Carcinoma ventriculi)
35%
Kolorektaalne vähi
30%
Pärasoobavähk
25%
Söögitoru vähk
20%
Maksavähk
15%
Otsi näitajat
MSI (mikrosatelliitide ebastabilisuse) uuring
MSI (mikrosatelliidi ebastabilsus)
Mitokondriaalse genoomi sekveneerimine
Terve genoomi sekveneerimine
BRCA2 geeni mutatsiooni uuring
CNV-uuring (Koopiate arvuse variatsioonide uuring)
Dermatogeneetika uuring
FANCD2 uuring
Genoomse impressiooni defektide uuring
Homoloogilise rekombinatsiooni funktsiooni uuring
KLF1 uuring
MET eksoni 14 vahelejätuse mutatsiooni uuring
MMACHC uuring
MMR geenidefekti uuring
MSH2 proteiini uuring
MSH6 proteiini uuring
Mikrodeletsioonide uuring
Mikromassiivide CGH (aCGH) uuring
Mismatch reparatsioonifunktsiooni uuring
Mitokondriaalse fissiooni uuring