Tuumori mutatsioonikoormus (TMB)
Kvantitatiivne · mutations/Mb
Näitaja kohta
Tuumori mutatsioonikoormus (TMB) on näitaja, mis kirjeldab mutatsioonide koguarvu pahaloomuse koe genoomis. Seda kasutatakse immunoterapia vastuse prognoosimiseks ning patsiendi personaliseeritud ravistrateegia kujundamiseks.
Funktsioon
- TMB mõõdab somaatiliste mutatsioonide arvu tuumori genoomis (tavaliselt mutatsioonide arvu megabaasi kohta).
- Kõrgem TMB viitab suuremale tõenäosusele, et tuumor toodab uusi antigeene, mida immuunsüsteem ära tunneb.
- Seda kasutatakse olulise biomarkerina immunoterapeutiliste ravimite, näiteks PD-1/PD-L1 inhibiitorite, efektiivsuse hindamisel.
Päritolu ja määramine
- TMB määratakse järgmisel põhjalise sekveneerimise (NGS) teel, analüüsides spetsiifiliste geenide või kogu genoomi piirkondi.
- Seda arvutatakse tavaliselt tuumori DNA ja normaalkoe DNA võrdlusel.
- Tulemused võivad olla erinevad sõltuvalt kasutatavast testiplaatvormist ja bioinformaatika protokollidest.
Protseduur
- Tuumorikoe biopsia võtamine: Saadakse väike tuumoriproov (näiteks nõelbiopsia või operatsioonilise eemaldamise käigus).
- DNA eraldamine ja ettevalmistamine: Tuumorist ja normaalkoest (nt verest) eraldatakse DNA.
- Järgmise põlvkonna sekveneerimine (NGS): DNA sekveneeritakse, et tuvastada mutatsioonid spetsiifilistes geenides või genoomi piirkondades.
- Bioinformaatiline analüüs: Arvutatakse mutatsioonide koguarv ja teisendatakse see väärtuseks mutatsioonide arvuna megabaasi kohta (mut/Mb).
- Aruande koostamine: Tulemus esitatakse koos interpretatsiooniga, mis võib hinnata TMB taset (nt madal, keskmine, kõrge).
Valmistumine
- Patsient peab andma nõusoleku biopsia protseduuriks.
- Enne biopsiat võib olla vajalikud vereanalüüsid verejooksu riski hindamiseks.
- Proovi kvaliteet on kriitiline, seetõttu tuleb see õigesti säilitada ja transportida.
Kliiniline tähendus
- Kõrge TMB on seotud parema vastusega immuunkontrollpunkti inhibiitoritele (nt pembrolizumaab, nivolumaab).
- Seda peetakse biomarkeriks, mis võib aidata valida patsiente, kellel on suurem tõenäosus immunoterapia kasust.
- Kõrge TMB võib olla iseloomulik teatud pahaloomustele, nagu nahamelaanoom, kopsuvähk (väikerakuline ja mitte-väikerakuline) ja kolorektaalvähi teatud alamtüüpidele.
Põhjused
- Keskkonnamutageenide (nt tubakasuvist, UV-kiirgus) pikaajaline mõju.
- DNA parandusmehhanismide defektid (nt MSI kõrge seisund).
- Mõned pahaloomused on kaasasündinud kalduvusega koguda mutatsioone (nt DNA parandusgeenide mutatsioonid).
Peamised olukorrad
- Metastaatilise või kohalikult edenenud pahaloomuse korral, kus kaalutakse immunoterapia alustamist.
- Kui teised biomarkerid (nt PD-L1) on ebaselged või negatiivsed, kuid patsiendi seisund võimaldab immunoterapiat.
- Personaliseeritud onkoloogia raames ravivaliku optimeerimiseks.
- Kliiniliste uuringute patsientide valimisel, mis hõlmavad immunoterapiat.
Spetsialistid
- Onkoloog võib määrata TMB analüüsi patsiendi ravivõimaluste hindamiseks.
- Patoloog või molekulaarmeditsiini spetsialist teostab testi ja tõlgendab tulemusi koos onkoloogiga.
Seotud uuringud
Otsi näitajat
Tumori mutatsioonikoormuse (TMB) uuring
11-dehidrotromboksaani B2
11-deoksükortisool
13q deletsiooni uuring
14-3-3 valk CSF-is
16-alfa-hüdroksüestron
17-alfa-hüdroksüprogesteroon
17-hüdroksüprogesteroon
1q amplifikatsiooni uuring
2-hüdroksüestrioon
2-metoksüestron
2-tunnine glükoositaluvuse test
216 toidu intolerantsuse uuring
24 tunni uriinikreatiinini tase
24-tunnine Holteri monitorimine
24-tunnine pH-meetria
24-tunnine uriinalbumiin
24-tunnine uriini fosfor
24-tunnine uriini kaalium
24-tunnine uriini tsüstiin