Tuumori mutatsioonikoormus (TMB)

Kvantitatiivne · mutations/Mb

Näitaja kohta

Tuumori mutatsioonikoormus (TMB) on näitaja, mis kirjeldab mutatsioonide koguarvu pahaloomuse koe genoomis. Seda kasutatakse immunoterapia vastuse prognoosimiseks ning patsiendi personaliseeritud ravistrateegia kujundamiseks.

Funktsioon
  • TMB mõõdab somaatiliste mutatsioonide arvu tuumori genoomis (tavaliselt mutatsioonide arvu megabaasi kohta).
  • Kõrgem TMB viitab suuremale tõenäosusele, et tuumor toodab uusi antigeene, mida immuunsüsteem ära tunneb.
  • Seda kasutatakse olulise biomarkerina immunoterapeutiliste ravimite, näiteks PD-1/PD-L1 inhibiitorite, efektiivsuse hindamisel.
Päritolu ja määramine
  • TMB määratakse järgmisel põhjalise sekveneerimise (NGS) teel, analüüsides spetsiifiliste geenide või kogu genoomi piirkondi.
  • Seda arvutatakse tavaliselt tuumori DNA ja normaalkoe DNA võrdlusel.
  • Tulemused võivad olla erinevad sõltuvalt kasutatavast testiplaatvormist ja bioinformaatika protokollidest.
Protseduur
  • Tuumorikoe biopsia võtamine: Saadakse väike tuumoriproov (näiteks nõelbiopsia või operatsioonilise eemaldamise käigus).
  • DNA eraldamine ja ettevalmistamine: Tuumorist ja normaalkoest (nt verest) eraldatakse DNA.
  • Järgmise põlvkonna sekveneerimine (NGS): DNA sekveneeritakse, et tuvastada mutatsioonid spetsiifilistes geenides või genoomi piirkondades.
  • Bioinformaatiline analüüs: Arvutatakse mutatsioonide koguarv ja teisendatakse see väärtuseks mutatsioonide arvuna megabaasi kohta (mut/Mb).
  • Aruande koostamine: Tulemus esitatakse koos interpretatsiooniga, mis võib hinnata TMB taset (nt madal, keskmine, kõrge).
Valmistumine
  • Patsient peab andma nõusoleku biopsia protseduuriks.
  • Enne biopsiat võib olla vajalikud vereanalüüsid verejooksu riski hindamiseks.
  • Proovi kvaliteet on kriitiline, seetõttu tuleb see õigesti säilitada ja transportida.
Kliiniline tähendus
  • Kõrge TMB on seotud parema vastusega immuunkontrollpunkti inhibiitoritele (nt pembrolizumaab, nivolumaab).
  • Seda peetakse biomarkeriks, mis võib aidata valida patsiente, kellel on suurem tõenäosus immunoterapia kasust.
  • Kõrge TMB võib olla iseloomulik teatud pahaloomustele, nagu nahamelaanoom, kopsuvähk (väikerakuline ja mitte-väikerakuline) ja kolorektaalvähi teatud alamtüüpidele.
Põhjused
  • Keskkonnamutageenide (nt tubakasuvist, UV-kiirgus) pikaajaline mõju.
  • DNA parandusmehhanismide defektid (nt MSI kõrge seisund).
  • Mõned pahaloomused on kaasasündinud kalduvusega koguda mutatsioone (nt DNA parandusgeenide mutatsioonid).
Peamised olukorrad
  • Metastaatilise või kohalikult edenenud pahaloomuse korral, kus kaalutakse immunoterapia alustamist.
  • Kui teised biomarkerid (nt PD-L1) on ebaselged või negatiivsed, kuid patsiendi seisund võimaldab immunoterapiat.
  • Personaliseeritud onkoloogia raames ravivaliku optimeerimiseks.
  • Kliiniliste uuringute patsientide valimisel, mis hõlmavad immunoterapiat.
Spetsialistid
  • Onkoloog võib määrata TMB analüüsi patsiendi ravivõimaluste hindamiseks.
  • Patoloog või molekulaarmeditsiini spetsialist teostab testi ja tõlgendab tulemusi koos onkoloogiga.