Tumori mutatsioonikoormuse (TMB) uuring
Kvantitatiivne · mutations/Mb
Näitaja kohta
Tumori mutatsioonikoormuse (TMB) uuring on täpsusmeditsiini geneetiline analüüs, mis määrab mutatsioonide arvu kasvaja DNA-s. Seda kasutatakse immunoterapia tõhususe prognoosimiseks. Kõrgem TMB väärtus viitab tavaliselt suuremale tõenäosusele positiivsele vastusele immuunravile.
Funktsioon
- Määrab kasvaja genoomis leiduvate somaatiliste mutatsioonide koguarvu (tavaliselt mutatsioonide arv megapaasi kohta).
- Peamine eesmärk on hinnata patsiendi vastuvõtlikkust immunoterapiale (nt PD-1/PD-L1 inhibiitoritele).
- Kõrgem TMB väärtus viitab suuremale tõenäosusele, et immuunsüsteem tunneb ära ja ründab kasvajarakke.
Lähtematerjal ja meetod
- Uuring tehakse kasvaja koe proovist (biopsia) või vedelikbiopsiast (verest).
- DNA sekveneerimiseks kasutatakse järgmise põlvkonna sekveneerimist (NGS).
- Tulemus väljendatakse mutatsioonide/megapaas (mut/Mb) arvuna.
Protseduur
- Koe kogumine: patoloog võtab kasvaja koe proovi biopsia teel või kasutab varasemat kirurgiliselt eemaldatud koesampli.
- DNA ekstraheerimine ja sekveneerimine: laboris eraldatakse kasvajarakkude DNA ning tehakse NGS analüüs, et tuvastada kõik somaatilised mutatsioonid.
- Andmetöötlus: spetsiaalne tarkvara arvutab mutatsioonide arvu genoomi pikkuse ühiku kohta.
Ettevalmistus
- Erilist ettevalmistust patsiendi poolt tavaliselt ei vaja.
- Oluline on, et kasvaja koeproov oleks piisavalt kvaliteetne ja sisaldaks piisavalt kasvajarakke.
- Vedelikbiopsia puhul on vaja vereproovi, mida analüüsitakse ringleva kasvaja DNA (ctDNA) järgi.
Peamised põhjused
- Kasvajad, mis on seotud keskkonnamutageenidega (nt melanoom seoses UV-kiirgusega, kopsuvähk seoses suitsetamisega).
- Kasvajad, millel on DNA parandusmehhanismide defektid (nt mikrosatelliidi ebastabiilsus, MSI-H).
- Mõned pahaloomulised kasvajad, nagu urooteliaalkartsinoom, maovähk ja emakakaelavähk, võivad omada kõrget TMB-d.
Kliiniline tähtsus
- Kõrge TMB on üks olulisemaid biomarkereid positiivse immuunvastuse ennustamiseks.
- Patsiendid kõrge TMB-ga on suurema tõenäosusega kandidaadid immunoterapiale (nt immuunkontrollpunkti inhibiitoritele).
- Uuringud on näidanud, et kõrge TMB-ga patsientidel on pikem üleelamine immunoterapia korral võrreldes traditsioonilise raviga.
Peamised olukorrad
- Metastaatilise või lokaalselt edenenud kasvaja korral, kus kaalutakse immunoterapia alustamist.
- Kui traditsioonilised ravimeetodid (keemoterapia, siirdterapia) on ebaefektiivsed.
- Kasvajate puhul, mille kohta on teada, et neil võib olla kõrge TMB (nt melanoom, kopsuvähk, põievähi teatud tüübid).
- Täpsusravi kontekstis, kui otsitakse kõige sobivamat raviviisi konkreetse patsiendi ja kasvaja jaoks.
Kes tellib uuringu?
- Onkoloog – spetsialist kasvajahaiguste diagnostikas ja ravis.
- Kliiniline geneetik või molekulaarpatoog – spetsialistid geneetiliste testide tõlgendamisel.
- Radioterapeut – vajadusel koostöös onkoloogiga, et valida parim ravistrateegia.
Seotud uuringud
Otsi näitajat
Tuumori mutatsioonikoormus (TMB)
Wilmsi tumori WT1 geen
BAP1 mutatsiooni uuring
CD47 ekspressiooni uuring
Ga68-PSMA-PET/CT uuring
Hormoonirütmi uuring
KIT D816V mutatsiooni uuring
Mikromassiivide CGH (aCGH) uuring
Neeruarterite duplex-uuring
Retinoblastoomi Rb-geeni uuring
STK11 mutatsioonide uuring
T790M resistentsusmutatsiooni uuring
Vedelbiopsia uuring
Vedelbiopsia vähimärkide uuring
miR-34a uuring
p53 funktsiooni uuring
11-dehidrotromboksaani B2
11-deoksükortisool
13q deletsiooni uuring
14-3-3 valk CSF-is