Tumori mutatsioonikoormuse (TMB) uuring

Kvantitatiivne · mutations/Mb

Näitaja kohta

Tumori mutatsioonikoormuse (TMB) uuring on täpsusmeditsiini geneetiline analüüs, mis määrab mutatsioonide arvu kasvaja DNA-s. Seda kasutatakse immunoterapia tõhususe prognoosimiseks. Kõrgem TMB väärtus viitab tavaliselt suuremale tõenäosusele positiivsele vastusele immuunravile.

Funktsioon
  • Määrab kasvaja genoomis leiduvate somaatiliste mutatsioonide koguarvu (tavaliselt mutatsioonide arv megapaasi kohta).
  • Peamine eesmärk on hinnata patsiendi vastuvõtlikkust immunoterapiale (nt PD-1/PD-L1 inhibiitoritele).
  • Kõrgem TMB väärtus viitab suuremale tõenäosusele, et immuunsüsteem tunneb ära ja ründab kasvajarakke.
Lähtematerjal ja meetod
  • Uuring tehakse kasvaja koe proovist (biopsia) või vedelikbiopsiast (verest).
  • DNA sekveneerimiseks kasutatakse järgmise põlvkonna sekveneerimist (NGS).
  • Tulemus väljendatakse mutatsioonide/megapaas (mut/Mb) arvuna.
Protseduur
  • Koe kogumine: patoloog võtab kasvaja koe proovi biopsia teel või kasutab varasemat kirurgiliselt eemaldatud koesampli.
  • DNA ekstraheerimine ja sekveneerimine: laboris eraldatakse kasvajarakkude DNA ning tehakse NGS analüüs, et tuvastada kõik somaatilised mutatsioonid.
  • Andmetöötlus: spetsiaalne tarkvara arvutab mutatsioonide arvu genoomi pikkuse ühiku kohta.
Ettevalmistus
  • Erilist ettevalmistust patsiendi poolt tavaliselt ei vaja.
  • Oluline on, et kasvaja koeproov oleks piisavalt kvaliteetne ja sisaldaks piisavalt kasvajarakke.
  • Vedelikbiopsia puhul on vaja vereproovi, mida analüüsitakse ringleva kasvaja DNA (ctDNA) järgi.
Peamised põhjused
  • Kasvajad, mis on seotud keskkonnamutageenidega (nt melanoom seoses UV-kiirgusega, kopsuvähk seoses suitsetamisega).
  • Kasvajad, millel on DNA parandusmehhanismide defektid (nt mikrosatelliidi ebastabiilsus, MSI-H).
  • Mõned pahaloomulised kasvajad, nagu urooteliaalkartsinoom, maovähk ja emakakaelavähk, võivad omada kõrget TMB-d.
Kliiniline tähtsus
  • Kõrge TMB on üks olulisemaid biomarkereid positiivse immuunvastuse ennustamiseks.
  • Patsiendid kõrge TMB-ga on suurema tõenäosusega kandidaadid immunoterapiale (nt immuunkontrollpunkti inhibiitoritele).
  • Uuringud on näidanud, et kõrge TMB-ga patsientidel on pikem üleelamine immunoterapia korral võrreldes traditsioonilise raviga.
Peamised olukorrad
  • Metastaatilise või lokaalselt edenenud kasvaja korral, kus kaalutakse immunoterapia alustamist.
  • Kui traditsioonilised ravimeetodid (keemoterapia, siirdterapia) on ebaefektiivsed.
  • Kasvajate puhul, mille kohta on teada, et neil võib olla kõrge TMB (nt melanoom, kopsuvähk, põievähi teatud tüübid).
  • Täpsusravi kontekstis, kui otsitakse kõige sobivamat raviviisi konkreetse patsiendi ja kasvaja jaoks.
Kes tellib uuringu?
  • Onkoloog – spetsialist kasvajahaiguste diagnostikas ja ravis.
  • Kliiniline geneetik või molekulaarpatoog – spetsialistid geneetiliste testide tõlgendamisel.
  • Radioterapeut – vajadusel koostöös onkoloogiga, et valida parim ravistrateegia.