Glükoproteoomika

Kirjeldav

Näitaja kohta

Glükoproteoomika on proteoomika haru, mis spetsialiseerub glükoproteiinide – valkude, millele on lisatud suhkrurühmad – ulatuslikule uurimisele. See teadusvaldkond analüüsib glükosilatsiooni mustreid, et mõista nende rolli rakuprotsessides, haiguste patogeneesis ja biomarkerite avastamisel. Glükoproteoomikat rakendatakse nii põhi- kui ka kliinilises uuringutes, et avastada uusi diagnostilisi sihtmärke ja ravimehhanisme.

Mis on glükoproteoomika?

Funktsioon

Glükoproteoomika kaardistab ja kvantifitseerib glükoproteiinide kogu kompleksi (glükoproteoomi) proovis.
See võimaldab analüüsida glükosilatsiooni muutusi, mis on seotud erinevate füsioloogiliste seisundite ja haigustega, nagu vähk, põletikulised haigused ja viirused.

Kulg

See integreerib meetodeid biokeemiast, proteoomikast ja glykobiologiast.
Glükoproteoomika arengut on kiirendanud tehnoloogilised edusammud, eriti kõrge lahutusvõimega massspektromeetria ja bioinformaatika.

Uuringu protseduur ja analüüs

Protseduur

Proovi (nt veri, koe ekstrakt) ettevalmistamine ja glükoproteiinide eraldamine.
Glükopeptiidide või glükoproteiinide lõhkumine ensüümidega ja/või keemilise modifikatsiooniga.
Eraldatud komponentide analüüs kõrge täpsusega massspektromeetria (LC-MS/MS) abil.
Saadud andmete töötlemine ja interpretatsioon spetsiaalse tarkvaraga, et identifitseerida glükoproteiinid ja nende glükosilatsioonikohad.

Glükoproteoomika tulemuste interpretatsioon

Mida võivad näidata muutused?

Konkreetsete glükoproteiinide või glükosilatsioonimustrite tuvastamist võib seostada haigusprotsessidega (nt spetsiifilised biomarkerid).
Kvantitatiivsed muutused glükoproteiinide tasemes võivad viidata haiguse aktiivsusele, prognoosile või ravivastusele.
Anomaalsed glükosilatsioonimustrid on leitud paljudes vähivormides, autoimmuunhaigustes ja kaasasündinud ainevahetushäiretes.

Praktiline tähendus

Tulemused aitavad teadlastel ja kliinikutel paremini mõista haiguse mehhanisme.
Avastatud biomarkereid saab kasutada uute diagnostiliste testide või sihtmärgiteraapia väljatöötamisel.

Indikatsioonid: millal rakendatakse glükoproteoomikat?

Peamised rakendusvaldkonnad

Biomarkerite otsing uute haigusdiagnoosimise või prognoosi meetodite jaoks.
Ravimite mõju hindamine glükosilatsioonile (farmakoglükoproteoomika).
Põhiteaduslikud uuringud raku signaaliradadest ja molekulaarsetest interaktsioonidest.
Kvaliteedikontroll biotehnoloogiliste ravimite (nt monoklonaalsete antikehade) tootmisel.

Kaasatud spetsialistid